Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms