Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp48Q3V0C5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp48Q3V0C5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp48Q3V0C5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp48Q3V0C5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp48Q3V0C5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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