Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm29609Q3UU56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm29609Q3UU56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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