Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbsponQ3UPR9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsponQ3UPR9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsponQ3UPR9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsponQ3UPR9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsponQ3UPR9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbsponQ3UPR9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms