Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3UPC7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3UPC7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms