Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms