Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ssbp4Q3U4B1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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