Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms