Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms