Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3TTJ4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms