Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700066B19RikQ3TS39 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms