Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms