Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2f1Q3THK3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2f1Q3THK3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms