Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cpne9Q1RLL3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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