Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rpusd2Q149F1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd2Q149F1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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