Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atp2b3Q0VF55 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp2b3Q0VF55 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms