Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms