Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Itgb8Q0VBD0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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