Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc7a1Q09143 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc7a1Q09143 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc7a1Q09143 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc7a1Q09143 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc7a1Q09143 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms