Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms