Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MestQ07646 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MestQ07646 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MestQ07646 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MestQ07646 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MestQ07646 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MestQ07646 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MestQ07646 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MestQ07646 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms