Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox10Q04888 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox10Q04888 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms