Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a1Q04857 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms