Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelaQ04207 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelaQ04207 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms