Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb2Q00977 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms