Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gfi1P70338 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfi1P70338 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms