Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54lP70270 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms