Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uchl4P58321 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms