Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms