Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FmodP50608 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FmodP50608 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms