Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfbP49766 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms