Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd22P35329 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms