Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms