Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms