Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms