Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrgP28705 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms