Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms