Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms