Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18528 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms