Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18524 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18524 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms