Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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