Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms