Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxa5P09021 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms