Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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TtrP07309 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TtrP07309 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TtrP07309 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TtrP07309 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TtrP07309 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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