Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SlkO54988 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SlkO54988 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SlkO54988 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms