Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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