Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brd1E9PZ26 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms