Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms