Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Grik3B1AS29 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Grik3B1AS29 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Grik3B1AS29 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Grik3B1AS29 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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