Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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